안녕하십니까?
제노마인 프로테옴 서비스입니다.
현재 제노마인에는 nanoLC - Q star 가 setting되어 있으나, 안정적인 서비스를 위해 최적화과정을 거치고 있습니다. 약 2개월 후에는 본격적인 서비스가 가능하리라고 생각이 됩니다.
현재로서 가능한 것은 MALDI-TOF를 이용한 분석인데, 말씀하신 두가지의 조건에서 서로다른 mass spectrum이 관찰이 되면 그 peptide의 cystein존재 여부확인과 함께 inter-molecular disulfied bond참여의 여부에 대한 해석을 할 수 있으리라 생각됩니다.
다만 원하는 peptide가 물리적인 성질상 다른 peptide와의 competition에 의해서 상대적으로 낮은 intensity로 관찰이 되거나 detection이 되지 않으면 성공적인 해석이 되지 않을 것입니다.
이 부분은 시도해봐야 그럴 가능성의 여부가 판단이 됩니다.
이런 점을 감안하시어, 검토하신 후 의뢰여부를 메일로 다시한번 알려주시면 감사하겠습니다.
그리고 c-terminal만 따로 sequencing을 하지는 못하고, internal peptide의 일부를 sequencing하고 있습니다.
분석료는 홈페이지를 참조하시면 감사하겠습니다.
감사합니다.
이호찬 님의 원본글
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안녕하십니까.
구조를 알고있는 재조합 단백질의 구조확인을 의뢰하려 합니다.
구조확인을 하려고 하는 단백질은 분자량이 약 50000 정도되는 heavy chain 2개와 20000 정도되는 light chain 2개가 cystein bond들로 link 되어있는 단백질 입니다.
이 단백질을 tripsin으로 효소분해한 검체와, DTT로 cystein bond를 환원한 후 역시 tripsin으로 효소분해한 검체를 각각 LC/MS로 측정하게 되면 변화하는 peak를 추적해 Mass로 peptide sequencing을 한 후 link된 cystein bond의 위치를 확인할 수 있는 것으로 알고 있습니다.
이러한 분석을 귀사에서도 수행할 수 있는지 알고싶습니다.
또한 효소분해한 후 heavy chain과 light chain의 C-terminal peptide의 sequencing도 가능한지 알고싶습니다.
분석이 가능한지와 비용이 얼마정도 드는지 알려주시기 바랍니다.
그럼 수고하세요.
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